В Узбекистане выявили ранее неизвестные мутации коронавируса

Исследования, проведенные в июле-августе 2021 года, дали возможность прочесть полный геном коронавируса SARS-CoV-2, который был выделен у 39 больных среднего и тяжелого течения болезни в Узбекистане.

Полный анализ генома клинических изолятов SARS-CoV-2 выявил в общей сложности 223 вариации на уровне нуклеотидов (SNP), из которых 34 были делециями, сообщили в пресс-службе Министерства инновационного развития.

Кроме того, были идентифицированы 2 ранее неопубликованные новые мутации, а именно мутации A85P и Y479N в неструктурированных белках Nsp13 и Nsp12. Мутация D614G обнаружена в S-белке всех изолятов.

Смотрите также:

COVID-19 в Узбекистане: прирост заболеваемости падает

Варианты SARS-CoV-2 в клинических изолятах проанализированы с помощью Nextstrain. Согласно результатам, наиболее распространенными вариантами в Узбекистане в июле-августе 2021 года являлись штаммы Дельта (82%), Альфа (10,3%) и 20А (7,7%).

По карте географического распространения штамм Delta можно разделить на группы России, Дании, США, Египта и Бангладеш. Стало известно, что обмен аминокислот ORF7a:P45L в дельта-штаммах играет важную роль в более тяжелом течении заболевания.

Настоящее исследование показало, что новая фаза рестабилизации Nsp13: A85P и Nsp12: Y479N, неправильное изменение ORF7a: P45L связано с тяжелым прогрессированием заболевания.

Геномные последовательности 39 секвенированных изолятов зарегистрированы в международных базах данных NCBI, GISAID.

Результаты были успешно опубликованы в научном журнале PLOS ONE.